VU (5-Vinyluridin)
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5-Vinyluridin (VU) ist ein Uridin-Derivat mit einer endständigen Alkengruppe, das anstelle von 5-Ethinyluridin (EU) zur Überwachung und Untersuchung der RNA-Transkription in Zellen verwendet werden kann.
VU wird leicht von lebenden Zellen aufgenommen und von RNA-Polymerasen anstelle von endogenem Uridin in de novo-RNA eingebaut, jedoch nicht in DNA [1]. VU-markierte naszierende zelluläre RNA kann schnell und mit hoher Empfindlichkeit über die inverse Elektronenbedarfs-Diels-Alder-Cycloadditionsreaktion (IEDDA) zwischen der Vinylgruppe und fluoreszenz- oder biotinmarkierten Tetrazinen nachgewiesen werden.
Markierte RNA kann mit verschiedenen Methoden zur Schätzung der Transkriptionsniveaus von Zellen nachgewiesen werden, z. B. Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie.
[1] Liu H.S. et al. A Nucleoside Derivative 5-Vinyluridine (VrU) for Imaging RNA in Cells and Animals. Bioconjug.Chem. 2019. 30(11). 2958-2966.
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Erscheinungsform: | weißer Feststoff |
Molekülmasse: | 270.24 |
CAS-Nummer: | 55520-64-4 |
Molekülformel: | C11H14N2O6 |
Löslichkeit: | DMSO, Methanol |
Qualitätskontrolle: | NMR 1H und HPLC-MS (≥95 %) |
Lagerungsbedingungen: | 24 Monate ab dem Wareneingang bei −20 °C an einem lichtgeschützten Ort. Transport: bei Raumtemperatur bis zu drei Wochen. Trocken lagern. |
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