R6G-Phosphoramidit, 6-Isomer

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R6G-Phosphoramidit für die Oligonukleotidsynthese, reines 6-Isomer.

R6G (Rhodamin 6G) ist ein Xanthenfarbstoff aus der Gruppe der Rhodamine. Er besitzt eine hervorragende Quantenausbeute und einen hohen Extinktionskoeffizienten. Die Absorptions- und Emissionsmaxima von 6-R6G sind bezogen auf die von Fluorescein in den langwelligen Bereich verschoben und liegen jeweils bei 518 nm und 542 nm.

R6G kann als FRET-Akzeptor in der DNA-Sequenzierung und in der STR-Analyse eingesetzt werden. Der Farbstoff wird auch häufig zur Herstellung von TaqMan-Sonden für die qPCR verwendet. Im Vergleich zu den Farbstoffen HEX und JOE zeigt R6G zusammen mit BHQ1-Quencher eine stärkere Fluoreszenzlöschung in molecular beacons-Sonden, was die Hintergrundfluoreszenz erheblich reduziert.

Anwendungsempfehlungen:

Kopplungszeit: 10 Minuten.

Entschützen: tert-Butylaminlösung in Wasser (Mischungsverhältnis 1:3) über Nacht bei 55 °C.

Bei Entschützung modifizierter Oligonukleotide von der festen Phase darf keine wässrige Ammoniaklösung oder AMA (eine 1:1 Mischung aus konzentriertem Ammoniak und 40%igem Methylamin) verwendet werden, da dies eine vollständige und irreversible Zerstörung von R6G nach sich ziehen würde.

Absorptions- und Emissionsspektren von 6-R6G

Absorptions- und Emissionsspektren von 6-R6G

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Cyanin3-Azid

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Kupfer(II)-TBTA-Komplex

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Allgemeine Eigenschaften

Erscheinungsform: gelbliches Pulver
Molekülmasse: 949.93
CAS-Nummer: 1355330-47-0
Molekülformel: C46H54F6N5O8P
Löslichkeit: gut löslich in Acetonitril und DCM
Qualitätskontrolle: NMR 1H und 31P, HPLC-MS (95+ %), Isomerenreinheit >97 %
Lagerungsbedingungen: Lagerung: 12 Monate nach Wareneingang bei −20 °C im Dunkeln. Transport: bei Raumtemperatur bis zu zwei Wochen. Längere Lichteinwirkung vermeiden. Trocken lagern.
Sicherheitsdatenblatt: herunterladen
Product specifications

Spektrale Eigenschaften

Anregungs-/Absorptionsmaximum / nm: 518
ε / L⋅mol−1⋅cm−1: 116000
Emissionsmaximum / nm: 542
Fluoreszenz-Quantenausbeute: 0.95
CF260: 0.18
CF280: 0.17

Verdünnungsmittel: Acetonitril
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