VIC-Phosphoramidit, 6-Isomer

Phosphoramidite VIC
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VIC ist ein asymmetrischer Xanthenfarbstoff (zwei seiner Seitenringe tragen unterschiedliche Substituenten). Dieser Farbstoff wird zur Markierung von qPCR-Sonden eingesetzt. Die spektralen Eigenschaften von VIC ähneln denen von HEX und JOE.

Dieses Phosphoramiditreagenz erlaubt eine Markierung am 5’-Ende eines Oligonukleotids.

Anwendungsempfehlungen:

Kopplungszeit: 10 Minuten.

Das Entschützen erfolgt unter Standardbedingungen mit 25%igem Ammoniak; die Dauer hängt dabei von den vorliegenden Nukleinbasen und ihren Schutzgruppen ab. Alternativ kann man dafür auch AMA verwenden, eine 1:1-Mischung aus konzentriertem wässrigem Ammoniak und 40%igem wässrigem Methylamin (15 Minuten bei 65 °C). Dabei entsteht allerdings kleine Menge ein Nebenprodukt.

VIC-Phosphoramidit, 6-Isomer, FH260
VIC-Phosphoramidit, 6-Isomer, FH260
VIC-Phosphoramidit, 6-Isomer, FH260
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Absorptions- und Emissionsspektren von 6-VIC

Absorptions- und Emissionsspektren von 6-VIC

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Allgemeine Eigenschaften

Erscheinungsform: weißer Feststoff
Molekülmasse: 1023.39
CAS-Nummer: 1414265-81-8
Molekülformel: C52H59Cl3N3O10P
Qualitätskontrolle: NMR 1H, 31P und HPLC-MS (≥95 %)
Lagerungsbedingungen: 12 Monate ab dem Wareneingang bei −20 °C an einem lichtgeschützten Ort. Transport: bei Raumtemperatur bis zu drei Wochen. Trocken lagern. Längere Lichteinwirkung vermeiden.
Sicherheitsdatenblatt: herunterladen
Product specifications

Spektrale Eigenschaften

Anregungs-/Absorptionsmaximum / nm: 525
ε / L⋅mol−1⋅cm−1: 103000
Emissionsmaximum / nm: 546
Fluoreszenz-Quantenausbeute: 0.53
CF260: 0.07
CF280: 0.07

Verdünnungsmittel: Acetonitril
Kopplungsbedingungen: Standardkopplung, identisch zu normalen Nukleinbasen
Schutzgruppen entfernen: dentisch zu geschützten Nukleinbasen
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