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Reagenzien für die Oligonukleotidsynthese
Xanthen-Phosphoramidite und -Trägermaterialien (außer FAM)
JOE-Phosphoramidit, 6-Isomer

JOE-Phosphoramidit, 6-Isomer

JOE Oligonukleotidsynthese Phosphoramidite

Artikel-Nr.	Packungseinheit	Preis	Vorlaufzeit
12160 / Leicht lösliche lyophilisierte Form in einer 8-ml-Septumflasche	100 mg	$110	Auf Lager
D2160 / Легкорастворимая лиофилизированная форма во флаконе septum 8 мл	250 mg	$165	Auf Lager
F2160 / Leicht lösliche lyophilisierte Form in einer 30-ml-Septumflasche	1 g	$575	Auf Lager
G2160	5 g	$2230	Auf Lager
H2160	10 g	$4180	Auf Lager
K2160	20 g	auf Anfrage	Auf Lager

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JOE-Phosphoramidit für die Synthese von Oligonukleotiden, reines 6-Isomer (6-JOE).

JOE ist ein Fluorescein-Derivat mit zwei Chloratomen und zwei Methoxygruppen. Mit seinem Absorptionsmaximum bei 503 nm und dem Emissionsmaximum bei 525 nm liegt der Fluorophor spektral zwischen FAM und TAMRA/ROX und wird deshalb häufig in Multiplex-Anwendungen eingesetzt, unter anderem in der DNA-Sequenzierung.

Sie finden in unserem Katalog auch das 5-Isomer des JOE-Phosphoramidits. In einer qPCR haben wir Sonden mit den beiden JOE-Isomeren (5-JOE und 6-JOE) verglichen und dabei keine wesentlichen Unterschiede festgestellt.

Anwendungsempfehlungen:

Kopplungszeit: 6 Minuten.

Das Entschützen erfolgt unter Standardbedingungen mit Ammoniak; die Dauer hängt dabei von den vorliegenden Nukleinbasen und ihren Schutzgruppen ab (das Entschützen für 17 Stunden bei 55 °C entfernt alle Schutzgruppen von den Standardnukleinbasen). Alternativ kann man dafür auch AMA verwenden, eine 1:1-Mischung aus 30%igem Ammoniak und 40%igem wässrigem Methylamin. Dabei entsteht allerdings zu 5 % ein nicht fluoreszierendes Nebenprodukt. Um die Entstehung dieses Nebenprodukts zu vermeiden, beginnen Sie das Entschützen zunächst nur mit 30%igem Ammoniak (30 Minuten bei Raumtemperatur), fügen Sie dann dasselbe Volumen an 40%igem wässrigem Methylamin hinzu und setzen Sie das Entschützen wie mit AMA gewohnt fort (beispielsweise 10 Minuten bei 65 °C).

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Absorptions- und Emissionsspektren von JOE

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TR ist ein rot emittierender fluoreszierender Farbstoff, der auf einem Sulforhodamingerüst basiert. Das ist ein Derivat zur Markierung von Aminen.

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Allgemeine Eigenschaften

Erscheinungsform:	weißer Feststoff
Molekülmasse:	972.88
Molekülformel:	C₄₈H₆₀N₃Cl₂O₁₂P
Löslichkeit:	gut löslich in Acetonitril und DCM
Qualitätskontrolle:	NMR ¹H und ³¹P, HPLC-MS
Lagerungsbedingungen:	Lagerung: 12 Monate nach Wareneingang bei −20 °C im Dunkeln. Transport: bei Raumtemperatur bis zu drei Wochen. Längere Lichteinwirkung vermeiden. Trocken lagern.
Sicherheitsdatenblatt:	herunterladen
	Product specifications

Spektrale Eigenschaften

Anregungs-/Absorptionsmaximum / nm:	533
ε / L⋅mol⁻¹⋅cm⁻¹:	75000
Emissionsmaximum / nm:	554
Fluoreszenz-Quantenausbeute:	0.61
CF₂₆₀:	0.36
CF₂₈₀:	0.28

Verdünnungsmittel:

Acetonitril

Dieses Produkt wird nur für Forschungszwecke angeboten und verkauft. Es wurde nicht auf Sicherheit und Wirksamkeit in Nahrungsmitteln, pharmazeutischen Produkten, medizinischen Vorrichtungen, Kosmetika sowie für gewerbliche oder andere Einsatzzwecke getestet. Der Verkauf gewährt oder impliziert nicht die Erlaubnis zur Verwendung in der In-vitro-Diagnostik, bei der Herstellung von Nahrungsmitteln oder pharmazeutischen Produkten, in medizinischen Vorrichtungen sowie in kosmetischen Erzeugnissen.