JOE-Phosphoramidit, 6-Isomer
| Artikel-Nr. | Packungseinheit | Preis | Vorlaufzeit | Jetzt kaufen |
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12160
/ Leicht lösliche lyophilisierte Form in einer 8-ml-Septumflasche
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100 mg | $110 | Auf Lager | |
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D2160
/ Легкорастворимая лиофилизированная форма во флаконе septum 8 мл
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250 mg | $165 | Auf Lager | |
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F2160
/ Leicht lösliche lyophilisierte Form in einer 30-ml-Septumflasche
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1 g |
$575
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Auf Lager | |
| G2160 | 5 g |
$2230
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Auf Lager | |
| H2160 | 10 g |
$4180
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Auf Lager | |
| K2160 | 20 g | auf Anfrage | Auf Lager |
JOE-Phosphoramidit für die Synthese von Oligonukleotiden, reines 6-Isomer (6-JOE).
JOE ist ein Fluorescein-Derivat mit zwei Chloratomen und zwei Methoxygruppen. Mit seinem Absorptionsmaximum bei 503 nm und dem Emissionsmaximum bei 525 nm liegt der Fluorophor spektral zwischen FAM und TAMRA/ROX und wird deshalb häufig in Multiplex-Anwendungen eingesetzt, unter anderem in der DNA-Sequenzierung.
Sie finden in unserem Katalog auch das 5-Isomer des JOE-Phosphoramidits. In einer qPCR haben wir Sonden mit den beiden JOE-Isomeren (5-JOE und 6-JOE) verglichen und dabei keine wesentlichen Unterschiede festgestellt.
Anwendungsempfehlungen:
Kopplungszeit: 6 Minuten.
Das Entschützen erfolgt unter Standardbedingungen mit Ammoniak; die Dauer hängt dabei von den vorliegenden Nukleinbasen und ihren Schutzgruppen ab (das Entschützen für 17 Stunden bei 55 °C entfernt alle Schutzgruppen von den Standardnukleinbasen). Alternativ kann man dafür auch AMA verwenden, eine 1:1-Mischung aus 30%igem Ammoniak und 40%igem wässrigem Methylamin. Dabei entsteht allerdings zu 5 % ein nicht fluoreszierendes Nebenprodukt. Um die Entstehung dieses Nebenprodukts zu vermeiden, beginnen Sie das Entschützen zunächst nur mit 30%igem Ammoniak (30 Minuten bei Raumtemperatur), fügen Sie dann dasselbe Volumen an 40%igem wässrigem Methylamin hinzu und setzen Sie das Entschützen wie mit AMA gewohnt fort (beispielsweise 10 Minuten bei 65 °C).
Absorptions- und Emissionsspektren von JOE
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Allgemeine Eigenschaften
| Erscheinungsform: | weißer Feststoff |
| Molekülmasse: | 972.88 |
| Molekülformel: | C48H60N3Cl2O12P |
| Löslichkeit: | gut löslich in Acetonitril und DCM |
| Qualitätskontrolle: | NMR 1H und 31P, HPLC-MS |
| Lagerungsbedingungen: | Lagerung: 12 Monate nach Wareneingang bei −20 °C im Dunkeln. Transport: bei Raumtemperatur bis zu drei Wochen. Längere Lichteinwirkung vermeiden. Trocken lagern. |
| Sicherheitsdatenblatt: | herunterladen |
| Product specifications |
Spektrale Eigenschaften
| Anregungs-/Absorptionsmaximum / nm: | 533 |
|
ε |
75000 |
| Emissionsmaximum / nm: | 554 |
| Fluoreszenz-Quantenausbeute: | 0.61 |
| CF260: | 0.36 |
| CF280: | 0.28 |
| Verdünnungsmittel: | Acetonitril |
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