TET-Phosphoramidit, 6-Isomer
| Artikel-Nr. | Packungseinheit | Preis | Vorlaufzeit | Jetzt kaufen |
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C8160
/ Leicht lösliche lyophilisierte Form in einer 8-ml-Septumflasche
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100 mg |
–
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D8160
/ Leicht lösliche lyophilisierte Form in einer 8-ml-Septumflasche
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250 mg |
$229.90
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F8160
/ Leicht lösliche lyophilisierte Form in einer 20-ml-Septumflasche
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1 g |
$659.90
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| G8160 | 5 g |
$2599.00
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| H8160 | 10 g |
auf Anfrage
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TET-Phosphoramidit für die Synthese fluoreszenzmarkierter Oligonukleotide, reines 6-Isomer.
TET, Tetrachlorfluorescein ist ein Fluoresceinderivat mit Emission im grünen Bereich des Spektrums, dessen Absoprtions- und Emissionsmaxima bei 519 nm bzw. 535 nm liegen.
TET-Phosphoramidit findet Anwendung in der Synthese von fluoreszenzmarkierten Primer und Hybridisierungssonden für die qPCR. Dabei benutzt man TET am effizientesten zusammen mit dem nicht fluoreszierenden Quencher DusQ® 1 (passend dazu kann man einen DusQ® 1 CPG 500-Träger mit einer Porengröße von 500 Å verwenden).
Die 5’-markierten Primer werden zusammen mit einem unmarkierten reversen Primer für die PCR-Amplifikation von Mikrosatelliten und die anschließende Fragmentanalyse eingesetzt. TET-markierte Amplifikationsprodukte können auf einer Vielzahl von Kapillarelektrophoresesequenzern analysiert werden, einschließlich dem ABI PRISM® 310 Genetic Analyzer.
Anwendungsempfehlungen:
Das Entschützen erfolgt unter Standardbedingungen mit 25%igem Ammoniak; die Dauer hängt dabei von den vorliegenden Nukleinbasen und ihren Schutzgruppen ab (das Entschützen für 17 Stunden bei 55 °C entfernt alle Schutzgruppen von den Standardnukleinbasen). Alternativ kann man dafür auch AMA verwenden, eine 1:1-Mischung aus konzentriertem Ammoniak und 40%igem wässrigem Methylamin. Dabei entsteht allerdings zu 5 % ein nicht fluoreszierendes Nebenprodukt. Um die Entstehung dieses Nebenprodukts zu vermeiden, beginnen Sie das Entschützen zunächst nur mit 30%igem Ammoniak (30 Minuten bei Raumtemperatur), fügen Sie dann dasselbe Volumen an 40%igem wässrigem Methylamin hinzu und setzen Sie das Entschützen wie mit AMA gewohnt fort (beispielsweise 10 Minuten bei 65 °C).
Absorptions- und Emissionsspektren von TET
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Allgemeine Eigenschaften
| Erscheinungsform: | weißes Pulver |
| Molekülmasse: | 981.72 |
| CAS-Nummer: | 877049-90-6 |
| Molekülformel: | C46H54N3Cl4O10P |
| IUPAC-Name: | 2',4,7,7'-tetrachloro-6-((6-(((2-cyanoethoxy)(diisopropylamino)phosphaneyl)oxy)hexyl)carbamoyl)-3-oxo-3H-spiro[isobenzofuran-1,9'-xanthene]-3',6'-diyl bis(2,2-dimethylpropanoate) |
| Löslichkeit: | gut löslich in Acetonitril und Dichlormethan |
| Qualitätskontrolle: | NMR 1H and 31P, HPLC-MS (95%), Funktionstest |
| Lagerungsbedingungen: | Lagerung: 12 Monate nach Wareneingang bei −20 °C im Dunkeln. Transport: bei Raumtemperatur bis zu drei Wochen. Längere Lichteinwirkung vermeiden. Trocken lagern. |
| Sicherheitsdatenblatt: | herunterladen |
| Product specifications |
Spektrale Eigenschaften
| Anregungs-/Absorptionsmaximum / nm: | 519 |
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ε |
100000 |
| Emissionsmaximum / nm: | 535 |
| Fluoreszenz-Quantenausbeute: | 0.47 |
| CF260: | 0.17 |
| CF280: | 0.09 |
| Verdünnungsmittel: | wasserfreies Acetonitril (Stellen Sie eine 0.1 M Lösung her, Lagerung 1 Woche) |
| Kopplungsbedingungen: | Kopplungsdauer 3 Minuten |
| Schutzgruppen entfernen: | 25%igem Ammoniak; AMA, eine 1:1-Mischung aus konzentriertem Ammoniak und 40%igem wässrigem Methylamin |
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