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Cyanine5 phosphoramidite

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Cyanine5 is one of the dyes that are used in qPCR. The corresponding filter set is found on many qPCR machines.

This reactive derivative is useful for the synthesis of qPCR probes having Cyanine5 at 5′-end, the most typical location of the fluorophore. This is a terminating, non-nucleoside reagent.

Amidite group in this reagent is bound to a secondary oxygen. This provides extra stability against Arbuzov rearrangement - a reaction that leads to amidite deterioration in solution in oligonucleotide synthesizer. This molecular design increases the stability of the reagent, maintaining efficient coupling over a longer time.

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AF 647-Azid

Azidderivat des Farbstoffs AF 647 für die Markierung von alkinhaltigen Molekülen und Fluoreszenzvisualisierung biologischer Objekte.

Universelles CPG-Trägermaterial Typ II, 500 Å

Ein vielseitig einsetzbarer Festphasenträger für Immobilisierung von Nukleosiden bei einer Oligonukleotidsynthese und beschleunigte Dephosphorylierung des 3'-Endes beim Entschützen. Das 500 Å controlled pore glass wird die Synthese von Oligonukleotiden mit einer Länge von bis zu 50 Basen empfohlen.

AF 647 NHS-Ester

Es ist ein heller, wasserlöslicher Succinimidester von AF 647-Farbstoff zur Markierung von Proteinen und Antikörpern.

General properties

Appearance: dark colored solid
Molecular weight: 816.49
Molecular formula: C47H67N5ClO3P
Quality control: NMR 1H, 31P, HPLC-MS (80%)
Storage conditions: Storage: 12 months after receival at -20°C in the dark. Transportation: at room temperature for up to 3 weeks. Avoid prolonged exposure to light. Desiccate.
Sicherheitsdatenblatt: herunterladen
Product specifications

Spectral properties

Excitation/absorption maximum, nm: 646
ε, L⋅mol−1⋅cm−1: 250000
Emission maximum, nm: 662
Fluorescence quantum yield: 0.2
CF260: 0.03
CF280: 0.04

Oligo synthesis details

Diluent: acetonitrile
Coupling conditions: 6 min coupling time recommended
Deprotection conditions: recommended 48 h at +4°C or ultramild protective groups; 24 h at rt possible
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