SIMA-Phosphoramidit, 6-Isomer (Hydroxyprolinol)
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SIMA-Phosphoramidit (Hydroxyprolinol), das 6-Isomer, enthält den Xanthenfarbstoff Dichlordiphenylfluorescein (SIMA), der in seinen spektralen Eigenschaften HEX ähnlich ist. Der SIMA-Phosphoramidit ist aber deutlich stabiler, wenn er unter basischen Bedingungen unter Verwendung einer wässrigen Ammoniaklösung bei erhöhten Temperaturen oder mit Hilfe von AMA (Mischung 1:1, konzentriertes wässriges Ammoniak / 40 % wässriges Methylamin) bei Raumtemperatur für 2 Stunden oder 65°C für 10 Minuten entschützt wird.
Dieser Modifikator basiert auf Hydroxyprolinol sowie einer Dimethoxytrityl-Schutzgruppe zur Reinigung auf Umkehrphasen-HPLC, C18-Kartuschen.
Bei der Entschützung mit wässrigem Ammoniak bei 55°C über Nacht ist an das Oligonukleotid gebundenes SIMA stabil.
Absorptions- und Emissionsspektren von SIMA
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Allgemeine Eigenschaften
| Erscheinungsform: | weißes Pulver |
| Molekülmasse: | 1480.52 |
| Molekülformel: | C84H89Cl2N4O14P |
| IUPAC-Name: | 6-((6-(2-((bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy)methyl)-4-(((2-cyanoethoxy)(diisopropylamino)phosphaneyl)oxy)pyrrolidin-1-yl)-6-oxohexyl)carbamoyl)-4,7-dichloro-3-oxo-2',7'-diphenyl-3H-spiro[isobenzofuran-1,9'-xanthene]-3',6'-diyl bis(2,2-dimethylpropanoate) |
| Löslichkeit: | gut in Acetonitril und DCM |
| Qualitätskontrolle: | NMR 1H und 31P, HPLC-MS (95%), Funktionstest |
| Lagerungsbedingungen: | 12 Monate nach Wareneingang bei −20 °C im Dunkeln. Transport: bei Raumtemperatur bis zu drei Wochen. Längere Lichteinwirkung vermeiden. Trocken lagern. |
| Sicherheitsdatenblatt: | herunterladen |
| Product specifications |
Spektrale Eigenschaften
| Anregungs-/Absorptionsmaximum / nm: | 531 |
|
ε |
92300 |
| Emissionsmaximum / nm: | 555 |
| Fluoreszenz-Quantenausbeute: | 0.63 |
| CF260: | 0.57 |
| CF280: | 0.18 |
| Verdünnungsmittel: | Acetonitril |
| Kopplungsbedingungen: | Kopplungsdauer 3 Minuten |
| Schutzgruppen entfernen: | Standardbedingungen unter Verwendung von 25% Ammoniak; die Entschützungszeit wird durch den Satz Nukleinbasen und deren Schutzgruppen bestimmt. Die Verwendung von AMA (1:1-Mischung, konzentriertes wässriges Ammoniak/40 % wässriges Methylamin) für 2 Stunden bei Raumtemperatur oder 10 Minuten bei 65 °C ist möglich. |
Dieses Produkt wird nur für Forschungszwecke angeboten und verkauft. Es wurde nicht auf Sicherheit und Wirksamkeit in Nahrungsmitteln, pharmazeutischen Produkten, medizinischen Vorrichtungen, Kosmetika sowie für gewerbliche oder andere Einsatzzwecke getestet. Der Verkauf gewährt oder impliziert nicht die Erlaubnis zur Verwendung in der In-vitro-Diagnostik, bei der Herstellung von Nahrungsmitteln oder pharmazeutischen Produkten, in medizinischen Vorrichtungen sowie in kosmetischen Erzeugnissen.
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