VIC-Phosphoramidit, 6-Isomer
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VIC ist ein asymmetrischer Xanthenfarbstoff (zwei seiner Seitenringe tragen unterschiedliche Substituenten). Dieser Farbstoff wird zur Markierung von qPCR-Sonden eingesetzt. Die spektralen Eigenschaften von VIC ähneln denen von HEX und JOE.
Dieses Phosphoramiditreagenz erlaubt eine Markierung am 5’-Ende eines Oligonukleotids.
Anwendungsempfehlungen:
Kopplungszeit: 10 Minuten.
Das Entschützen erfolgt unter Standardbedingungen mit 25%igem Ammoniak; die Dauer hängt dabei von den vorliegenden Nukleinbasen und ihren Schutzgruppen ab. Alternativ kann man dafür auch AMA verwenden, eine 1:1-Mischung aus konzentriertem wässrigem Ammoniak und 40%igem wässrigem Methylamin (15 Minuten bei 65 °C). Dabei entsteht allerdings kleine Menge ein Nebenprodukt.
Absorptions- und Emissionsspektren von 6-VIC
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Allgemeine Eigenschaften
| Erscheinungsform: | weißer Feststoff |
| Molekülmasse: | 1023.39 |
| CAS-Nummer: | 1414265-81-8 |
| Molekülformel: | C52H59Cl3N3O10P |
| Qualitätskontrolle: | NMR 1H, 31P und HPLC-MS (≥95 %) |
| Lagerungsbedingungen: | 12 Monate ab dem Wareneingang bei −20 °C an einem lichtgeschützten Ort. Transport: bei Raumtemperatur bis zu drei Wochen. Trocken lagern. Längere Lichteinwirkung vermeiden. |
| Sicherheitsdatenblatt: | herunterladen |
| Product specifications |
Spektrale Eigenschaften
| Anregungs-/Absorptionsmaximum / nm: | 525 |
|
ε |
103000 |
| Emissionsmaximum / nm: | 546 |
| Fluoreszenz-Quantenausbeute: | 0.53 |
| CF260: | 0.07 |
| CF280: | 0.07 |
| Verdünnungsmittel: | Acetonitril |
| Kopplungsbedingungen: | Standardkopplung, identisch zu normalen Nukleinbasen |
| Schutzgruppen entfernen: | dentisch zu geschützten Nukleinbasen |
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