Cyanin 5 NHS-Ester

Proteinmarkierung Cyanin 5 NHS-Ester Mikroskopie
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In den vergangenen Jahren ist der Cyanin-5-Fluorophor (Analogon zu Cy5®) zu einem sehr beliebten Farbmarker in der biowissenschaftlichen Forschung und Diagnostik geworden. Die Fluoreszenzemission ist im Rotbereich am stärksten, wo viele CCD-Detektoren ihre größte Nachweisempfindlichkeit aufweisen und biologische Objekte einen geringen Fluoreszenz-Hintergrund haben. Die Fluoreszenz ist sehr intensiv, weshalb bereits so geringe Mengen wie ein Nanomol bei der Gelelektrophorese mit dem bloßen Auge detektiert werden können.

Dieser Cyanin 5 NHS-Ester (analog dem Cy5® NHS-Ester) ist ein Reaktivfarbstoff für die Markierung von Aminogruppen in Peptiden, Proteinen und Oligonukleotiden. Dieser Farbstoff erfordert eine geringe Menge eines organischen Hilfslösungsmittels (wie zum Beispiel DMF oder DMSO) in der Markierungsreaktion (für ausführliche Informationen siehe unten „Empfohlenes Protokoll“). Dieses Reagenz ist in idealer Weise geeignet für eine sehr kosteneffiziente Markierung von löslichen Proteinen sowie von allen Arten von Peptiden und Oligonukleotiden. Dieses Reagenz eignet sich weiterhin gut in organischen Lösungsmitteln für die Markierung von niedermolekularen Verbindungen. Für anspruchsvollere Zielmoleküle, bei denen die Anwendung von DMF oder DMSO nicht wünschenswert ist, ziehen Sie bitte den Einsatz des wasserlöslichen Sulfo-Cyanin 5 NHS-Esters in Erwägung, der kein Hilfslösungsmittel erfordert und sehr ähnliche Fluoreszenzeigenschaften aufweist.

Der Fluorophor Cyanin 5 ist kompatibel mit verschiedenen Geräten wie unter anderem zahlreichen Fluoreszenzmikroskopen, Imagern, Scannern und Fluoreszenz-Lesegeräten. Es gibt eine Reihe verschiedener Cyanin-5-Analoga: Cyanin 5 NHS-Ester kann als Ersatz für die aktivierten Ester von Cy5® und DyLight 649 verwendet werden.

Cyanin 5 NHS-Ester
Cyanin 5 NHS-Ester
Cyanin 5 NHS-Ester
Struktur des Cyanin 5 NHS-Esters
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Anregungs- und Emissionspektren von Cyanin 5

Anregungs- und Emissionspektren von Cyanin 5

Empfohlenes Protokoll

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Allgemeine Eigenschaften

Erscheinungsform: dunkelblaues Pulver
Molekülmasse: 667.54
CAS-Nummer: 1263093-76-0
Molekülformel: C36H42N3BF4O4
IUPAC-Name: 3H-​Indolium, 2-​[5-​(1,​3-​dihydro-​1,​3,​3-​trimethyl-​2H-​indol-​2-​ylidene)​-​1,​3-​pentadien-​1-​yl]​-​1-​[6-​[(2,​5-​dioxo-​1-​pyrrolidinyl)​oxy]​-​6-​oxohexyl]​-​3,​3-​dimethyl-​, tetrafluoroborate
Löslichkeit: gut löslich in polaren (DMSO, DMF) und chlorierten (DCM, Chloroform) organischen Lösungsmitteln, geringe Löslichkeit in Wasser
Qualitätskontrolle: NMR 1H, HPLC-MS (95 %)
Lagerungsbedingungen: Lagerbeständigkeit: 12 Monate ab dem Wareneingang bei −20 °C an einem lichtgeschützten Ort. Transport: bei Raumtemperatur bis zu drei Wochen. Längere Leichteinwirkung vermeiden. Trocken lagern.
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Product specifications

Spektrale Eigenschaften

Anregungs-/Absorptionsmaximum / nm: 646
ε / L⋅mol−1⋅cm−1: 250000
Emissionsmaximum / nm: 662
Fluoreszenz-Quantenausbeute: 0.2
CF260: 0.03
CF280: 0.04

Zitierungen

  1. Gruenke, P.R.; Aneja, R.; Welbourn, S.; Ukah, O.B.; Sarafianos, S.G.; Burke, D.H.; Lange, M.J. Selection and identification of an RNA aptamer that specifically binds the HIV-1 capsid lattice and inhibits viral replication. Nucleic Acids Research, in press. doi: 10.1093/nar/gkab1293
  2. Janiszewski, T.; Kołt, S.; Kaiserman, D.; Snipas, S.; Li, S.; Kulbacka, J.; Saczko, J.; Bovenschen, N.; Salvesen, G.; Drąg, M.; Bird, P.I.; Kasperkiewicz, P. Noninvasive optical detection of Granzyme B from natural killer cells using enzyme-activated fluorogenic probes. bioRxiv, preprint. doi: 10.1101/2019.12.16.875070
  3. Poreba, M.; Groborz, K.; Rut, W.; Pore, M.; Snipas, S.J.; Vizovisek, M.; Turk, B.; Kuhn, P.; Drag, M.; Salvesen, G.S. The Activome: multiplexed probing of activity of proteolytic enzymes using mass cytometry-compatible activity-based probes (TOF-probes). bioRxiv, preprint. doi: 10.1101/775627
  4. Vakhrushev, A.V.; Demin, A.M.; Krasnov, V.P. Synthesis of fluorescent GRGD peptide derivatives. AIP Conference Proceedings, 2022, 2390(1), 020083. doi: 10.1063/5.0069274
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