DusQ® 2 dT Phosphoramidit

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DusQ® 2 dT-Phosphoramidit ist ein modifizierter Oligosynthesereagenz, der eine vollständig nichtfluoreszierende Quencher-Nukleinbase trägt und typischerweise zur internen Markierung von DNA-Oligonukleotid-Sonden verwendet wird. DusQ 2 hat einen großen Extinktionskoeffizienten und unterdrückt die Fluoreszenz effizient für Farbstoffe, die im fernen roten Bereich emittieren, wie zum Beispiel Cyanin5. DusQ 2 wird typischerweise verwendet, um qPCR-Sonden mit einem Quencher-Moiety zu konstruieren.

Der Reagenz enthält einen DMT-Schutz der Hydroxymethylgruppe, der die Reinigung der Oligonukleotide auf Kartuschen ermöglicht. DusQ 2 hat ein Absorptionsspektrum im roten und nahen Infrarotbereich und kann mit Reporterdyes gepaart werden, die im Bereich von 560-670 nm emittieren, z.B. TAMRA, ROX, Cyanin3 und Cyanin5.

Anwendung

Kopplung: 6 Minuten Kopplungszeit empfohlen.

Deprotektion: 2 Stunden bei Raumtemperatur unter Verwendung von Ammoniaklösung, oder 10 Minuten bei 65 °C mit AMA (Lösung von 30% Ammoniak/40% wässeriger Methylamin 1:1 V/V).

Die Deprotektionszeit hängt von der Zusammensetzung der Oligonukleotide und den Nukleinbase-Schutzgruppen sowie zusätzlichen Modifikationen ab.

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Cyanin3-Azid

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Allgemeine Eigenschaften

Erscheinungsform: schwarz farben Pulver
Molekülmasse: 1413.55
Molekülformel: C75H89N12O14P
Qualitätskontrolle: NMR 1H, 31P,HPLC-MS (95%)
Lagerungsbedingungen: 12 Monate nach Wareneingang bei −20 °C im Dunkeln. Transport: bei Raumtemperatur bis zu drei Wochen. Längere Lichteinwirkung vermeiden. Trocken lagern.
Sicherheitsdatenblatt: herunterladen
Product specifications

Spektrale Eigenschaften

Anregungs-/Absorptionsmaximum / nm: 552

Kopplungsbedingungen:
Abspaltungsbedingungen: Ammoniak, 2 Stunden bei Raumtemperatur
Schutzgruppen entfernen: identisch zu geschützten Nukleinbasen
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