AmdU (5-Azidomethyl-2'-desoxyuridin)

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Azidomethyl-dU (AmdU) ist ein Nukleosid, das eine Azidogruppe trägt. Die Struktur des Nukleosids ähnelt der von Thymidin. Genauso wie EdU wird es von zellulären Polymerasen in naszierende DNA eingebaut.

Im Gegensatz zu EdU, dessen weitere Modifikation mit Aziden eines Kupferkatalysators bedarf, kann AmdU auch ohne Katalysator in einer spAAC (strain-promoted alkyne-azide cycloaddition) Click-Chemie-Reaktion mit gespannten Cycloalkinen, wie z. B. Cyclooctinen, reagieren. Dies ermöglicht den Nachweis naszierender DNA unter unschädlichen, kupferfreien Bedingungen.

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EdU (5-Ethinyl-2'-desoxyuridin)

EdU ist ein Nukleosid, das durch zelluläre Enzyme während der Replikation in die DNA eingebaut wird. Nachfolgend kann die DNA durch eine Click-Chemie-Reaktion mit Fluoreszenzfarbstoffen konjugiert werden, um beispielsweise die Zellproliferation nachzuweisen.

DBCO NHS-Ester

Azodibenzocyclooctin (DBCO, ADIBO) für die kupferfreie Click-Chemie (strain promoted copper free Click chemistry, spAAC). Das Reagenz trägt eine NHS-Ester-Funktion für die Bindung an Aminogruppen verschiedener Moleküle.

Cumarin-343-X-azid

Cumarin 343 ist ein blau emittierender Fluorophor, der als FRET-Donor für Fluorescein (FAM) eingesetzt werden kann. Dieses Azidderivat kann in einer Click-Chemie-Reaktion mit Alkinen konjugiert werden. Der verlängerte Linker zwischen dem Farbstoff und der Azidogruppe verbessert die Löslichkeit und sorgt für einen größeren Abstand des Fluorophors zum markierten Biomolekül.

Allgemeine Eigenschaften

Erscheinungsform: weißer bis grau-weißer Feststoff
Molekülmasse: 283.24
Molekülformel: C10H13N5O5
IUPAC-Name: 5-Azidomethyl-2'-deoxyuridine
Löslichkeit: gut in Wasser, Alkoholen, DMSO, DMF
Qualitätskontrolle: NMR 1H, HPLC-MS (95 %)
Lagerungsbedingungen: Lagerung: 24 Monate nach Wareneingang bei −20 °C im Dunkeln. Transport: bei Raumtemperatur bis zu drei Wochen. Längere Lichteinwirkung vermeiden. Trocken lagern.
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