DusQ 1 dT Phosphoramidit

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DusQ 1 dT-Phosphoramidit ist ein modifizierter Oligosynthesereagenz, der eine echte dunkle Quencher-Nukleinbase trägt und typischerweise zur internen Markierung von DNA-Oligonukleotid-Sonden verwendet wird. DusQ 1 unterdrückt die Fluoreszenz effizient durch FRET-Unterdrückung und durch statische Unterdrückung durch Bildung eines Grundzustandskomplexes mit dem Reporterdye und wird typischerweise verwendet, um qPCR-Sonden mit einem Quencher-Moiety zu konstruieren.

Der Reagenz enthält einen DMT-Schutz der Hydroxymethylgruppe, der die Reinigung der Oligonukleotide auf Kartuschen ermöglicht. DusQ 1 kann mit Reporterdyes kombiniert werden, die im grünen bis gelben Bereich emittieren, um eine vollständig nichtfluoreszierende Kombination zu bilden. DusQ 1 hat ein breites Absorptionsspektrum mit einem Maximum im Bereich von 480-580 nm und arbeitet in Verbindung mit den häufig verwendeten Fluorophoren wie FAM, TET, JOE, HEX und Cyanin3.

Anwendung

Kopplung: 6 Minuten Kopplungszeit empfohlen.

Deprotektion: 2 Stunden bei Raumtemperatur unter Verwendung von Ammoniaklösung, oder 10 Minuten bei 65 °C mit AMA (Lösung von 30% Ammoniak/40% wässeriger Methylamin 1:1 V/V).

Die Deprotektionszeit hängt von der Zusammensetzung der Oligonukleotide und den Nukleinbase-Schutzgruppen sowie zusätzlichen Modifikationen ab.

Absorptionsspektrum von DusQ 1

Absorptionsspektrum von DusQ 1

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FAM NHS-Ester, 6-Isomer

N-Hydroxysuccinimidylester von Fluorescein (FAM), reines 6-Isomer

Allgemeine Eigenschaften

Erscheinungsform: schwarz farben Pulver
Molekülmasse: 1411.58
Molekülformel: C76H91N12O13P
Qualitätskontrolle: NMR 1H, 31P,HPLC-MS (95%)
Lagerungsbedingungen: Lagerung: 12 Monate nach Wareneingang bei −20 °C im Dunkeln. Transport: bei Raumtemperatur bis zu drei Wochen. Längere Lichteinwirkung vermeiden. Trocken lagern.
Sicherheitsdatenblatt: herunterladen
Product specifications

Spektrale Eigenschaften

Anregungs-/Absorptionsmaximum / nm: 522
ε / L⋅mol−1⋅cm−1: 27300

Kopplungsbedingungen:
Abspaltungsbedingungen: Ammoniak, 2 Stunden bei Raumtemperatur
Schutzgruppen entfernen: identisch zu geschützten Nukleinbasen
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