FAM-11-dUTP, 6-Isomer
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6-FAM-11-2’-desoxyuridin-5’-triphosphat, Trilithiumsalz, ist eine gebräuchliche Verbindung für die nicht-radioaktive DNA-Markierung.
FAM (Fluorescein) ist ein beliebter grün emittierender Farbstoff mit dem Fluoreszenzmaximum bei 513 nm. Bei diesem Derivat handelt es sich um ein reines FAM-6-Isomer.
Im Gegensatz zu Triphosphaten mit einem unmittelbar an Aminoallyl-dUTP gebundenen Farbstoff enthält dieses Triphosphat einen 11-atomigen Linker zwischen dem Fluorophor und der Stickstoffbase. Diese Linkerlänge verhindert ein mögliches statisches Quenching der FAM-Modifikation und erhöht die Effizienz des Nukleotideinbaus während der DNA-Synthese.
Man kann mit 6-FAM-11-dUTP ein markiertes Produkt während der Nick-Translation erzeugen. Synthetisierte fluoreszenzmarkierte DNA-Sonden können zum Nachweis spezifischer Sequenzen durch Southern Blot, Northern Blot, in situ-Hybridisierung oder durch Microarray-Analyse verwendet werden.
Absorptions- und Emissionsspektren von FAM
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Erscheinungsform: | gelber bis orangefarbener Feststoff |
Molekülmasse: | 1013.49 |
Molekülformel: | C39H39N4Li3O21P3 |
IUPAC-Name: | ((2R,3S,5R)-5-(5-(3-(6-(3-carboxy-4-(6-hydroxy-3-oxo-3H-xanthen-9-yl)benzamido)hexanamido)prop-1-yn-1-yl)-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-3-hydroxytetrahydrofuran-2-yl)methyl hydrogen triphosphate |
Löslichkeit: | löslich in Wasser |
Qualitätskontrolle: | HPLC-MS (95%), Funktionstest in Reaktion |
Lagerungsbedingungen: | Lagerung: 12 Monate nach Wareneingang bei −20 °C im Dunkeln. Transport: bei Raumtemperatur bis zu drei Wochen. Längere Lichteinwirkung und wiederholte Frier-Tau-Zyklen vermeiden. |
Sicherheitsdatenblatt: | herunterladen |
Product specifications |
Spektrale Eigenschaften
Anregungs-/Absorptionsmaximum / nm: | 492 |
ε |
74000 |
Emissionsmaximum / nm: | 517 |
Fluoreszenz-Quantenausbeute: | 0.93 |
CF260: | 0.22 |
CF280: | 0.17 |
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