dsGreen Gelfärbelösung, 10.000×

PCR und qPCR
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dsGreen, ein Analogon zu SYBR® Green I, ist ein sensitiver dsDNA-bindender Farbstoff, der für den Routinenachweis von DNA in Agarose- und Polyacrylamidgelen verwendet werden kann.

Im Gegensatz zu Ethidiumbromid ist dsGreen stark selektiv gegenüber doppelsträngiger DNA, weitaus weniger schädlich und bietet eine höhere Nachweisempflindlichkeit.

Vergleich zwischen Ethidiumbromid und dsGreen

EigenschaftenEthidiumbromiddsGreen
Fluoreszenz rot (615 nm) grün (524 nm)
Anregungsmaximum 302 nm 454 nm
Anregungslichtquelle nur UV Blaulicht oder UV
Nachweisempfindlichkeit 2 ng / Bande (dsDNA)
100 ng / Bande (RNA)		 0,08 ng / Bande (dsDNA)
1–2 ng / Bande (Oligonukleotide)
Gesundheitsgefährdung hoch gering

Anmerkung: Die Fluoreszenzeigenschaften von an dsDNA gebundenem SYBR Green I wurden der folgenden Veröffentlichung entnommen: Zipper, H.; Brunner, H.; Bernhagen, J.; Vitzthum, F. Investigations on DNA intercalation and surface binding by SYBR Green I, its structure determination and methodological implications. Nucleic Acids Res., 2004, 32, e103.

dsGreen Gelfärbelösung, 10.000×
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1% agarose gels with variable amount of plasmid stained by either dsGreen, or ethidium bromide. Plasmid quantities are in nanograms.
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Struktur von dsGreen I
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Anregungs- und Emissionsspektra des dsDNA-Komplexes mit dsGreen

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Allgemeine Eigenschaften

Erscheinungsform: orangefarbene Lösung
Qualitätskontrolle: NMR 1H, HPLC-MS (≥95 %), Funktionsprüfung
Lagerungsbedingungen: Lagerbeständigkeit: 24 Monate ab Wareneingang bei −20 °C an einem lichtgeschützten Ort. Transport: bei Raumtemperatur bis zu drei Wochen. Längere Lichteinwirkung vermeiden.
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Product specifications

Spektrale Eigenschaften

Anregungsmaximum / nm: 454
ε / L⋅mol−1⋅cm−1: 73000
Emissionsmaximum / nm: 524
Fluoreszenz-Quantenausbeute: 0.8

Zitierungen

  1. Chetverikov, P.E.; Craemer, C.; Cvrković, T.; Klimov, P.B.; Petanović, R.U.; Romanovich, A.E.; Sukhareva, S.I.; Zukoff, S.N.; Bolton, S.; Amrine, J. Molecular phylogeny of the phytoparasitic mite family Phytoptidae (Acariformes: Eriophyoidea) identified the female genitalic anatomy as a major macroevolutionary factor and revealed multiple origins of gall induction. Experimental & Applied Acarology, 2021, 83(1), 31–68. doi: 10.1007/s10493-020-00571-6
  2. Chetverikov, P.E.; Cvrković, T.; Efimov, P.G.; Klimov, P.B.; Petanović, R.U.; Romanovich, A.E.; Schubert, M.A.; Sukhareva, S.I.; Zukoff, S.N.; Amrine, J. Molecular phylogenetic analyses reveal a deep dichotomy in the conifer-inhabiting genus Trisetacus (Eriophyoidea: Nalepellidae), with the two lineages differing in their female genital morphology and host associations. Experimental and Applied Acarology, 2020, 81(3), 287–316. doi: 10.1007/s10493-020-00503-4
  3. Kirkham, C.M.; Scott, J.N.F.; Wang, X.; Smith, A.L.; Kupinski, A.P.; Ford, A.M.; Westhead, D.R.; Stockley, P.G.; Tuma, R.; Boyes, J. Cut-and-Run: A Distinct Mechanism by which V(D)J Recombination Causes Genome Instability. Molecular Cell, 2019, 74(3), 584–597.e9. doi: 10.1016/j.molcel.2019.02.025
  4. Komarova, N.; Andrianova, M.; Glukhov, S.; Kuznetsov, A. Selection, Characterization, and Application of {ssDNA} Aptamer against Furaneol. Molecules, 2018, 23(12), 3159. doi: 10.3390/molecules23123159
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