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JOE phosphoramidite, 5-isomer

Oligonukleotidsynthese JOE Phosphoramidite
Artikel-Nr. Packungseinheit Preis Vorlaufzeit
C1160 100 mg –   Auf Lager
D1160 250 mg $165 Auf Lager
F1160 1 g $575 Auf Lager
G1160 5 g $2230 Auf Lager
H1160 10 g $3300 Auf Lager
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JOE is a xanthene dye, fluorescein derivative possessing two chloro and two methoxy substituents. This fluorophore is a useful label for oligonucleotides. Its absorption and emission spectra are located between FAM and TAMRA.

The fluorophore can be introduced into oligonucleotide using this phosphoramidite. It tolerates standard ammonium deblock conditions. This product contains pure isomer of 5-JOE dye.

JOE-Phosphoramidit, 5-Isomer, F1160
JOE-Phosphoramidit, 5-Isomer, F1160
Struktur von 5-JOE-Phosphoramidit
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Absorptions- und Emissionsspektren des Fluorophors JOE

Absorptions- und Emissionsspektren des Fluorophors JOE

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General properties

Appearance: colorless solid
Molecular weight: 972.88
Molecular formula: C48H60N3Cl2O12P
Solubility: good in DCM, acetonitrile
Quality control: NMR 1H, 31P, HPLC-MS (95%), functional testing
Storage conditions: Storage: 12 months after receival at -20°C in the dark. Transportation: at room temperature for up to 3 weeks. Avoid prolonged exposure to light. Desiccate.
Sicherheitsdatenblatt: herunterladen
Product specifications

Spectral properties

Excitation/absorption maximum, nm: 533
ε, L⋅mol−1⋅cm−1: 75000
Emission maximum, nm: 554
Fluorescence quantum yield: 0.61
CF260: 0.36
CF280: 0.28

Oligo synthesis details

Diluent: acetonitrile
Coupling conditions: standard coupling, identical to normal nucleobases
Cleavage conditions: ammonia, 2 h at room temperature
Deprotection conditions: identical to protected nucleobases
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