TOR-G4, Fluoreszenzsonde für G-Quadruplexe

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G-Quadruplexe (G4s) sind sekundäre Strukturen, die sich in DNA und RNA durch nichtkanonische Wasserstoffbrückenbindungen zwischen vier Guaninbasen bilden [1,2]. Im Zellkern werden DNA-G4s mit der epigenetischen Regulation der Genexpression durch ihre Interaktionen mit regulatorischen Proteinen wie Transkriptionsfaktoren und Chromatinmodifikatoren in Verbindung gebracht [3,4]. RNA-G4s wurden mit RNA-Spleißen, Transport und Translationsregulation sowie RNA-vermittelten Stressreaktionen im Zytoplasma in Verbindung gebracht [5-7].

TOR-G4 ist ein Thiazol-Orange-Derivat, eine neu synthetisierte G4-Fluoreszenzsonde [8]. Es ist eine niedermolekulare Alternative zur Immunchemie mit G4-spezifischen Antikörpern. TOR-G4 ermöglicht die Visualisierung von G4s basierend auf Änderungen der Fluoreszenzlebensdauer der Sonde nach Bindung an Nukleinsäuren. Die Lebensdauer von TOR-G4 ist am höchsten in Gegenwart von G4s und niedriger bei anderen Sequenzen. Innerhalb von Zellen ist TOR-G4 hauptsächlich mit RNA im Zytoplasma und in den Nukleoli kolokalisiert und ist damit die erste auf der Lebensdauer basierende Sonde, die zur Erforschung der aufkommenden Rollen von RNA-G4s in der Zellfunktion validiert wurde. TOR-G4 eignet sich für die Bildgebung von RNA-G4s mittels FLIM [8].

[1] Trends in Chemistry 2, 123 (2020); [2] Nat Rev Mol Cell Biol 21, 459 (2020); [3] Nucleic Acids Res 49, 8419 (2021); [4] Trends Genet 35, 29 (2019); [5] Nucleic Acids Res 48, 12534 (2020); [6] Trends Biochem Sci 46, 270 (2021); [7] Nucleic Acids Res 49, 5426 (2021); [8] J Am Chem Soc 146, 1009 (2024).

Anregungs- und Emissionsspektren von TOR-G4 (G4 DNA (c-MYC))

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Allgemeine Eigenschaften

Erscheinungsform: schwarzer Feststoff
Molekülmasse: 607.56
Molekülformel: C30H30IN3OS
Löslichkeit: gut in DMSO
Qualitätskontrolle: NMR 1H und HPLC-MS (≥95 %)
Lagerungsbedingungen: 24 Monate ab dem Wareneingang bei −20 °C an einem lichtgeschützten Ort. Transport: bei Raumtemperatur bis zu drei Wochen. Trocken lagern.
Sicherheitsdatenblatt: herunterladen
Product specifications

Spektrale Eigenschaften

Anregungs-/Absorptionsmaximum / nm: 483; 567 (c-MYC complex)
Emissionsmaximum / nm: 648 (c-MYC complex)
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