Konjugationsreaktion von alkin- bzw. azidmodifizierten Proteinen mit Farbstoff-Aziden bzw. -Alkinen
Der Puffer für die Proteinmarkierung wird bei der CuAAC-Reaktion mit Proteinen eingesetzt und ist dafür optimiert, Biomoleküle vor Schädigung durch reaktive Sauerstoffspezies zu schützen. Für die Reaktion eignen sich alkin- bzw. azidmodifizierte Proteine sowie mit Azidgruppen metabolisch markierte Zellen oder Zelllysate.
Bei der Konjugationsreaktion eines Azids mit der terminalen Alkingruppe wird ein 5-gliedriger Heterozyklus — 1,2,3-Triazol gebildet. Da Azid- und Alkingruppen in natürlichen Biomolekülen praktisch nie vorkommen, ist die Reaktion sehr spezifisch und breit anwendbar.
Die Reaktion verläuft in Anwesenheit von Kupfer(I)-Verbindungen und ist kaum vom pH-Wert abhängig. Der Puffer für die Proteinmarkierung ist für die Arbeit mit Proteinen optimiert und enthält ein Kupfer(II)-Salz, einen stabilen Vorgänger katalytisch aktiver Kupfer(I)-Verbindungen, Triethylammoniumacetat pH 6.8, den wasserlöslichen Liganden THPTA und Aminoguanidin. Es wird empfohlen, Kupfer(II) mit einer frisch angesetzten Ascorbinsäure-Lösung zu reduzieren. Der Ligand THPTA im Puffer beschleunigt die Reaktion und stabilisiert katalytisch aktive Kupfer(I)-Verbindungen. Die Anwesenheit des wasserlöslichen THPTA erlaubt darüber hinaus die Durchführung der Reaktion im wässrigen Medium (ohne Zusatz organischer Hilfslösungsmittel). Durch die Stabilisierung von Kupfer(I)-Verbindungen minimiert THPTA die Entstehung reaktiver Sauerstoffspezies (ROS) und somit eine unerwünschte Schädigung der Proteine durch Oxidation von Histidin, Methionin und Cystein. Zusätzlich zugesetztes Aminoguanidin soll die Bindung reaktionsfähiger Aldehyde, die aus Dehydroascorbat durch Hydrolyse entstehen können, an die Seitenketten von Arginin, N-terminalem Cystein und Lysin verhindern.
Für die Reaktion werden ein in azidfreiem Puffer gelöstes alkin- bzw. azidmodifiziertes Protein, Farbstoff-Azid bzw. -Alkin, 1.5x Puffer für die Proteinmarkierung, Ascorbinsäure benötigt. Es wird empfohlen, Schritte 6-9 unter Inertgasatmosphäre (Stickstoff oder Argon) durchzuführen.
Protokoll
Wir empfehlen folgendes Protokoll für die Konjugation von modifizierten Proteinen mit Farbstoffderivaten:
- Berechnen Sie das Gesamtreaktionsvolumen abhängig von der Menge des modifizierten Proteins:
! Das Volumen der alkin- bzw. azidmodifizierten Proteinlösung darf maximal 1/3 des
Gesamtreaktionsvolumens betragen.
Gesamtreaktionsvolumen, µl Proteinmenge 100 von 4 bis 20 nmol 200 von 20 bis 40 nmol 400 von 40 bis 80 nmol 600 von 80 bis 600 nmol - Berechnen Sie die Volumina der für die Proteinmarkierung benötigten Reagenzien anhand der
untenstehenden Tabelle:
* - der Farbstoffüberschuss kann in Abhängigkeit von der Anzahl der Azid- bzw. Alkingruppen in Proteinmolekülen variieren. Die Berechnungen in der Tabelle beziehen sich auf den 3-fachen Farbstoffüberschuss. Für den 1.5–10-fachen Farbstoffüberschuss soll die Proteinmenge (nmol) mit 0.15–1 multipliziert werden. Beachten Sie jedoch bitte, dass bei Verwendung von Aziden bzw. Alkinen mit geringer Wasserlöslichkeit diese bei einem erheblichen Überschuss aus dem Reaktionsgemisch ausfallen können. Verwenden Sie daher wasserlösliche Farbstoffe wie sulfonierte Cyaninfarbstoffe sulfo-Cyanine.
Reagenz Volumen, µl Konzentration der Stammlösung Farbstoff-Azid oder -Alkin (Proteinmenge [nmol]) × 0.3* 10 mM in DMSO oder Wasser Puffer für die Proteinmarkierung (Gesamtreaktionsvolumen [µl]) × 0.67 1.5х Ascorbinsäure (Gesamtreaktionsvolumen [µl]) × 0.02 50 mM in Wasser Wasser (Gesamtreaktionsvolumen [µl]) – Volumen der Farbstofflösung [µl] – Puffervolumen [µl] – Volumen der Ascorbinsäurelösung [µl]) — - Bereiten Sie die Stammlösung des Farbstoff-Azids bzw. -Alkins (10 mM in DMSO oder Wasser für wasserlösliche Alkine und Azide) und Ascorbinsäure (50 mM in Wasser) zu. Beachten Sie bitte, dass Ascorbinsäure anfällig für Oxidation durch Luftsauerstoff ist. Verwenden Sie daher immer nur frisch angesetzte Lösungen (die Lösung ist 24 Stunden lang stabil). Bereiten Sie die Stammlösung zu, indem Sie 10 mg Ascorbinsäure in 1,1 ml Wasser auflösen.
- Fügen Sie den Puffer für die Proteinmarkierung zu der Lösung des modifizierten Proteins hinzu und vortexen Sie.
- Fügen Sie die Stammlösung des Farbstoff-Azids bzw. -Alkins hinzu und vortexen Sie noch einmal gut.
- (Empfohlen) Entgasen Sie die Lösung. Schließen Sie dafür eine Einmalpipettenspitze an den Plastik- bzw. Silikonschlauch des Druckreglers der Flasche mit Inertgas (Argon, Stickstoff) an. Stellen Sie einen sehr schwachen Gasstrom ein und halten Sie die Pipettenspitze 3-10 mm oberhalb des Flüssigkeitsspiegels. Berühren Sie dabei weder Flüssigkeit noch Röhrchenwände. Der Gasstrom muss so eingestellt sein, dass er einen Strudel in der Flüssigkeit erzeugt, das Verspritzen der Flüssigkeit ist jedoch zu vermeiden. Halten Sie die Pipettenspitze so 10–20 s lang. Werden mehrere Markierungsreaktionen parallel vorbereitet, kann mit einem Zentrifugalkonzentrator entgast werden. Platzieren Sie die Röhrchen im Gerät, starten Sie den Durchlauf, bauen Sie für 30–40 s Vakuum auf und leiten Sie anschließend Inertgas durch das Gerät.
- Fügen Sie die Ascorbinsäure-Lösung hinzu, leiten Sie einige Sekunden lang ein Inertgas durch das Röhrchen hindurch und verschließen Sie es.
- Vortexen Sie die Lösung.
- Inkubieren Sie das Gemisch bei Raumtemperatur für 8–16 Stunden.
- Reinigen Sie das Reaktionsprodukt mittels Dialyse oder Gelfiltration.
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Biotin-PEG4-Alkin
Biotin-Alkin ist ein Reagenz fur die Click-Chemie-Markierung mit dem Affinitätsmarker Biotin.
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| Artikel-Nr. | Packungseinheit | Preis | Vorlaufzeit | Jetzt kaufen |
|---|---|---|---|---|
| 2615-50mg | 50 mg | $125 | Auf Lager | |
| 2615-100mg | 100 mg | $185 | Auf Lager | |
| 2615-1g | 1 g |
$990
|
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Cyanin3-Alkin
Cyanin3-Alkin ist ein Fluoreszenzfarbstoff-Alkin für die Click-Chemie-Markierung von Biomolekülen.
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| Artikel-Nr. | Packungseinheit | Preis | Vorlaufzeit | Jetzt kaufen |
|---|---|---|---|---|
| A10B0 | 1 mg | $125 | Auf Lager | |
| B10B0 | 5 mg | $260 | Auf Lager | |
| C10B0 | 10 mg | $325 | Auf Lager | |
| D10B0 | 25 mg |
$510
|
Auf Lager | |
| E10B0 | 50 mg |
$895
|
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| F10B0 | 100 mg |
$1490
|
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Cyanin5.5-Alkin
Cyanin5.5-Alkin ist ein NIR-Farbstoff-Alkin für kupferkatalysierte Click-Chemie.
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| Artikel-Nr. | Packungseinheit | Preis | Vorlaufzeit | Jetzt kaufen |
|---|---|---|---|---|
| A70B0 | 1 mg | $125 | Auf Lager | |
| B70B0 | 5 mg | $260 | Auf Lager | |
| C70B0 | 10 mg | $325 | Auf Lager | |
| D70B0 | 25 mg |
$510
|
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| E70B0 | 50 mg |
$895
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| F70B0 | 100 mg |
$1490
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Cyanin5-Alkin
Cyanin5-Alkin ist ein Alkin-Farbstoff für die Click-Chemie-Markierung von Biomolekülen.
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| Artikel-Nr. | Packungseinheit | Preis | Vorlaufzeit | Jetzt kaufen |
|---|---|---|---|---|
| A30B0 | 1 mg | $125 | Auf Lager | |
| B30B0 | 5 mg | $260 | Auf Lager | |
| C30B0 | 10 mg | $325 | Auf Lager | |
| D30B0 | 25 mg |
$510
|
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| E30B0 | 50 mg |
$895
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| F30B0 | 100 mg |
$1490
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Cyanin7.5-Alkin
Reaktiver Nahinfrarot(NIR)-Fluorophor mit terminaler Ethinylgruppe für die Click-Chemie-Markierung von Biomolekülen.
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| Artikel-Nr. | Packungseinheit | Preis | Vorlaufzeit | Jetzt kaufen |
|---|---|---|---|---|
| A60B0 | 1 mg | $125 | Auf Lager | |
| B60B0 | 5 mg | $260 | Auf Lager | |
| C60B0 | 10 mg | $325 | Auf Lager | |
| D60B0 | 25 mg |
$510
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| E60B0 | 50 mg |
$895
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| F60B0 | 100 mg |
$1490
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Cyanin7-Alkin
Alkin des Nahinfrarot(NIR)-Farbstoffs Cyanin7 für die Click-Chemie-Markierung von Biomolekülen.
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| Artikel-Nr. | Packungseinheit | Preis | Vorlaufzeit | Jetzt kaufen |
|---|---|---|---|---|
| A50B0 | 1 mg | $125 | Auf Lager | |
| B50B0 | 5 mg | $260 | Auf Lager | |
| C50B0 | 10 mg | $325 | Auf Lager | |
| D50B0 | 25 mg |
$510
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| E50B0 | 50 mg |
$895
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| F50B0 | 100 mg |
$1490
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FAM-Alkin, 5-Isomer
Alkinderivat des Fluoreszenzfarbstoffs FAM für die Click-Chemie-Markierung von Biomolekülen.
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| Artikel-Nr. | Packungseinheit | Preis | Vorlaufzeit | Jetzt kaufen |
|---|---|---|---|---|
| A41B0 | 1 mg | – | Auf Lager | |
| B41B0 | 5 mg | $100 | Auf Lager | |
| C41B0 | 10 mg | $150 | Auf Lager | |
| D41B0 | 25 mg | $295 | Auf Lager | |
| E41B0 | 50 mg |
$450
|
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| F41B0 | 100 mg |
$780
|
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FAM-Alkin, 6-Isomer
Fluorescein-Alkin für die Click-Chemie-Markierung von Biomolekülen.
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| Artikel-Nr. | Packungseinheit | Preis | Vorlaufzeit | Jetzt kaufen |
|---|---|---|---|---|
| A51B0 | 1 mg | – | Auf Lager | |
| B51B0 | 5 mg | $100 | Auf Lager | |
| C51B0 | 10 mg | $150 | Auf Lager | |
| D51B0 | 25 mg | $295 | Auf Lager | |
| E51B0 | 50 mg |
$450
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| F51B0 | 100 mg |
$780
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Hexinsäure-NHS-Ester
Alkin-NHS-Ester zur Markierung von Biomolekülen mit einer Alkingruppe für die kupferkatalysierte Click-Chemie
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| Artikel-Nr. | Packungseinheit | Preis | Vorlaufzeit | Jetzt kaufen |
|---|---|---|---|---|
| 41720 | 25 mg | $95 | Auf Lager | |
| 51720 | 50 mg | $180 | Auf Lager | |
| 61720 | 100 mg | $290 | Auf Lager | |
| 91720 | 1 g | auf Anfrage | Auf Lager |
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Hexinsäure-STP-Ester
Aktivierter Ester mit einer terminalen Alkingruppe für die Modifizierung der Verbindungen, die eine Aminogruppe tragen. STP-Ester stellen eine ausgezeichnete Alternative zu NHS-Estern dar.
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| Artikel-Nr. | Packungseinheit | Preis | Vorlaufzeit | Jetzt kaufen |
|---|---|---|---|---|
| 569-25mg | 25 mg | $95 | Auf Lager | |
| 569-100mg | 100 mg | $185 | Auf Lager | |
| 569-500mg | 500 mg |
$850
|
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JOE-Alkin, 6-Isomer
JOE-Farbstoff-Alkin-Derivat für kupferkatalysierte Klickchemiereaktionen mit Aziden. Der JOE-Farbstoff wird häufig für die Markierung von Nukleinsäuren verwendet.
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| Artikel-Nr. | Packungseinheit | Preis | Vorlaufzeit | Jetzt kaufen |
|---|---|---|---|---|
| A21B0 | 1 mg | $110 | Auf Lager | |
| B21B0 | 5 mg | $210 | Auf Lager | |
| C21B0 | 10 mg | $310 | Auf Lager | |
| D21B0 | 25 mg |
$410
|
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| E21B0 | 50 mg |
$695
|
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| F21B0 | 100 mg |
$1190
|
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Kupfer(II)-THPTA-Katalysatorpuffer, 1,5x
Gebrauchsfertiger katalytischer Puffer mit THPTA für die Click-Chemie, eignet sich für die Modifizierung von Proteinen.
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| Artikel-Nr. | Packungseinheit | Preis | Vorlaufzeit | Jetzt kaufen |
|---|---|---|---|---|
| B5150 | 1 mL | $30 | Auf Lager | |
| K5150 | 10 mL | $120 | Auf Lager | |
| S5150 | 50 mL |
$490
|
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Pentinsäure-STP-Ester
Ein aktivierter Ester für die Alkinylierung von Peptiden/Proteinen.
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| Artikel-Nr. | Packungseinheit | Preis | Vorlaufzeit | Jetzt kaufen |
|---|---|---|---|---|
| 30720 | 10 mg | $110 | 5 Tagen. | |
| 40720 | 25 mg | $210 | Auf Lager | |
| 50720 | 50 mg |
$410
|
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| 60720 | 100 mg |
$595
|
5 Tagen. |
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R6G-Alkin, 6-Isomer
R6G (Rhodamin 6G) terminales Alkin für kupferkatalysierte schnelle chemische Reaktionen mit Aziden. Reines 6-Isomer des Farbstoffs.
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| Artikel-Nr. | Packungseinheit | Preis | Vorlaufzeit | Jetzt kaufen |
|---|---|---|---|---|
| A52B0 | 1 mg | $110 | Auf Lager | |
| B52B0 | 5 mg | $210 | Auf Lager | |
| C52B0 | 10 mg | $310 | Auf Lager | |
| D52B0 | 25 mg |
$410
|
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| E52B0 | 50 mg |
$695
|
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| F52B0 | 100 mg |
$1190
|
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ROX-Alkin, 5-Isomer
Alkinderivat von Rhodamine X (ROX, Rhodamin 101) für kupferkatalysierte Click-Chemie-Reaktionen.
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| Artikel-Nr. | Packungseinheit | Preis | Vorlaufzeit | Jetzt kaufen |
|---|---|---|---|---|
| A12B0 | 1 mg | $110 | Auf Lager | |
| B12B0 | 5 mg | $165 | Auf Lager | |
| C12B0 | 10 mg | $210 | Auf Lager | |
| D12B0 | 25 mg | $285 | Auf Lager | |
| E12B0 | 50 mg |
$495
|
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| F12B0 | 100 mg |
$1190
|
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ROX-Alkin, 6-Isomer
Ein Alkin-Derivat des hellrot-leuchtenden Farbstoffs ROX (Rhodamin X, Rhodamin 101) für die kupferkatalysierte Click-Chemie-Bioconjugation. Reines 6-Isomer.
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| Artikel-Nr. | Packungseinheit | Preis | Vorlaufzeit | Jetzt kaufen |
|---|---|---|---|---|
| A22B0 | 1 mg | $110 | Auf Lager | |
| B22B0 | 5 mg | $165 | Auf Lager | |
| C22B0 | 10 mg | $210 | Auf Lager | |
| D22B0 | 25 mg | $285 | Auf Lager | |
| E22B0 | 50 mg |
$495
|
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| F22B0 | 100 mg |
$880
|
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Sulfo-Cyanin3.5-Alkin
Alkinderivat des wasserlöslichen Fluoreszenzfarbstoffs Sulfo-Cyanin3.5 für kupferkatalysierte Click-Chemie-Reaktionen.
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| Artikel-Nr. | Packungseinheit | Preis | Vorlaufzeit | Jetzt kaufen |
|---|---|---|---|---|
| A23B0 | 1 mg | $125 | Auf Lager | |
| B23B0 | 5 mg | $260 | Auf Lager | |
| C23B0 | 10 mg | $325 | Auf Lager | |
| D23B0 | 25 mg |
$510
|
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| E23B0 | 50 mg |
$895
|
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| F23B0 | 100 mg |
$1490
|
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Sulfo-Cyanin3-Alkin
Ein wasserlösliches Fluorophor-Alkin für die kupferkatalysierte Click-Chemie. Sulfo-Cyanin3 ist ein heller und photostabiler Fluoreszenzfarbstoff für den Cy3®-Kanal.
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| Artikel-Nr. | Packungseinheit | Preis | Vorlaufzeit | Jetzt kaufen |
|---|---|---|---|---|
| A13B0 | 1 mg | $125 | Auf Lager | |
| B13B0 | 5 mg | $325 | Auf Lager | |
| C13B0 | 10 mg |
$470
|
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| D13B0 | 25 mg |
$850
|
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| E13B0 | 50 mg |
$1490
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| F13B0 | 100 mg |
$1990
|
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Sulfo-Cyanin5.5-Alkin
Wasserlöslicher, fernrot bzw. nahinfrarot emittierender Fluorophor Sulfo-Cyanin5.5 mit Alkingruppe
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| Artikel-Nr. | Packungseinheit | Preis | Vorlaufzeit | Jetzt kaufen |
|---|---|---|---|---|
| A73B0 | 1 mg | $110 | Auf Lager | |
| B73B0 | 5 mg | $325 | Auf Lager | |
| C73B0 | 10 mg |
$470
|
Auf Lager | |
| D73B0 | 25 mg |
$850
|
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| E73B0 | 50 mg |
$1490
|
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| F73B0 | 100 mg |
$2590
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Sulfo-Cyanin5-Alkin
Wasserlösliches Fluorophor Cyanin5 Alkinderivat für die Click-Chemie.
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| Artikel-Nr. | Packungseinheit | Preis | Vorlaufzeit | Jetzt kaufen |
|---|---|---|---|---|
| A33B0 | 1 mg | $125 | Auf Lager | |
| B33B0 | 5 mg | $290 | Auf Lager | |
| C33B0 | 10 mg |
$470
|
Auf Lager | |
| D33B0 | 25 mg |
$850
|
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| E33B0 | 50 mg |
$1490
|
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| F33B0 | 100 mg |
$1990
|
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Sulfo-Cyanin7.5-Alkin
Sulfo-Cyanin7.5 ist ein Nahinfrarotfluorophor, der Indocyaningrün (ICG) ähnelt, aber eine höhere Fluoreszenzquantenausbeute aufweist. Es handelt sich um ein Alkinderivat für kupferkatalysierte Click-Chemie-Reaktionen.
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| Artikel-Nr. | Packungseinheit | Preis | Vorlaufzeit | Jetzt kaufen |
|---|---|---|---|---|
| A63B0 | 1 mg | $125 | Auf Lager | |
| B63B0 | 5 mg | $325 | Auf Lager | |
| C63B0 | 10 mg |
$470
|
Auf Lager | |
| D63B0 | 25 mg |
$850
|
Auf Lager | |
| E63B0 | 50 mg |
$1490
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| F63B0 | 100 mg |
$1990
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Sulfo-Cyanin7-Alkin
Ein sulfoniertes und daher wasserlösliches Alkinderivat des Nahinfrarot-Fluorophors Cyanin7 für die kupferkatalysierte Cycloaddition mit Aziden.
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| Artikel-Nr. | Packungseinheit | Preis | Vorlaufzeit | Jetzt kaufen |
|---|---|---|---|---|
| A53B0 | 1 mg | $125 | Auf Lager | |
| B53B0 | 5 mg | $325 | Auf Lager | |
| C53B0 | 10 mg |
$470
|
Auf Lager | |
| D53B0 | 25 mg |
$850
|
Auf Lager | |
| E53B0 | 50 mg |
$1490
|
Auf Lager | |
| F53B0 | 100 mg |
$1990
|
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TAMRA-Alkin, 5-Isomer
Alkinderivat von TAMRA, reines 5-Isomer für die kupferkatalysierte Click-Chemie.
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| Artikel-Nr. | Packungseinheit | Preis | Vorlaufzeit | Jetzt kaufen |
|---|---|---|---|---|
| A71B0 | 1 mg | – | Auf Lager | |
| B71B0 | 5 mg | $260 | Auf Lager | |
| C71B0 | 10 mg | $325 | Auf Lager | |
| D71B0 | 25 mg |
$410
|
Auf Lager | |
| E71B0 | 50 mg |
$695
|
Auf Lager | |
| F71B0 | 100 mg |
$890
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TAMRA-Alkin, 6-Isomer
Tetramethylrhodamin (TAMRA) ist ein beliebter Fluorophor in der qPCR und anderen Anwendungen. TAMRA ist ein FRET-Akzeptor für FAM. Die terminale Alkingruppe wird in Click-Chemie-Reaktionen genutzt.
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| Artikel-Nr. | Packungseinheit | Preis | Vorlaufzeit | Jetzt kaufen |
|---|---|---|---|---|
| A81B0 | 1 mg | – | Auf Lager | |
| B81B0 | 5 mg | $260 | Auf Lager | |
| C81B0 | 10 mg | $325 | Auf Lager | |
| D81B0 | 25 mg |
$410
|
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| E81B0 | 50 mg |
$695
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