VU (5-Vinyluridin)

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5-Vinyluridin (VU) ist ein Uridin-Derivat mit einer endständigen Alkengruppe, das anstelle von 5-Ethinyluridin (EU) zur Überwachung und Untersuchung der RNA-Transkription in Zellen verwendet werden kann.

VU wird leicht von lebenden Zellen aufgenommen und von RNA-Polymerasen anstelle von endogenem Uridin in de novo-RNA eingebaut, jedoch nicht in DNA [1]. VU-markierte naszierende zelluläre RNA kann schnell und mit hoher Empfindlichkeit über die inverse Elektronenbedarfs-Diels-Alder-Cycloadditionsreaktion (IEDDA) zwischen der Vinylgruppe und fluoreszenz- oder biotinmarkierten Tetrazinen nachgewiesen werden.

Markierte RNA kann mit verschiedenen Methoden zur Schätzung der Transkriptionsniveaus von Zellen nachgewiesen werden, z. B. Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie.

[1] Liu H.S. et al. A Nucleoside Derivative 5-Vinyluridine (VrU) for Imaging RNA in Cells and Animals. Bioconjug.Chem. 2019. 30(11). 2958-2966.

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Allgemeine Eigenschaften

Erscheinungsform:	weißer Feststoff
Molekülmasse:	270.24
CAS-Nummer:	55520-64-4
Molekülformel:	C₁₁H₁₄N₂O₆
Löslichkeit:	DMSO, Methanol
Qualitätskontrolle:	NMR ¹H und HPLC-MS (≥95 %)
Lagerungsbedingungen:	24 Monate ab dem Wareneingang bei −20 °C an einem lichtgeschützten Ort. Transport: bei Raumtemperatur bis zu drei Wochen. Trocken lagern.
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