SIMA-dT-Phosphoramidit, 6-Isomer

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SIMA-dT-Phosphoramidit wird verwendet, um SIMA während der Oligonukleotidsynthese in die Sequenz einzuführen, üblicherweise als Ersatz für die native dT-Bindung. SIMA ist bekannt, in basischen Medien viel stabiler als HEX zu sein, daher ist eine Entschützung unter rauen Bedingungen mit Ammoniumhydroxid (bis zu 6-8 Stunden bei 55 °C) sowie AMA (1:1-Mischung aus konzentriertem wässrigem Ammoniumhydroxid/40 % wässrigem Methylamin) bei Raumtemperatur oder bei 65 °C möglich.

Anwendungsempfehlungen:

Kopplungszeit: empfohlene Ankoppelzeit ist 10 Minuten.

Entschützung: Standardmethode wird empfohlen, wobei die Entschützung mit AMA (1:1-Mischung aus konzentriertem wässrigem Ammoniumhydroxid/40 % wässrigem Methylamin) durchgeführt werden kann.

Absorptions- und Emissionsspektren von SIMA

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Allgemeine Eigenschaften

Erscheinungsform: weißes Puder
Molekülmasse: 1646.67
Molekülformel: C91H95Cl2N6O17P
Löslichkeit: gut löslich in Acetonitril und Dichlormethan
Qualitätskontrolle: NMR 1H und HPLC-MS (≥95 %)
Lagerungsbedingungen: 12 Monate ab dem Wareneingang bei −20 °C an einem lichtgeschützten Ort. Transport: bei Raumtemperatur bis zu drei Wochen. Trocken lagern. Längere Lichteinwirkung vermeiden.
Sicherheitsdatenblatt: herunterladen
Product specifications

Spektrale Eigenschaften

Anregungs-/Absorptionsmaximum / nm: 531
ε / L⋅mol−1⋅cm−1: 92300
Emissionsmaximum / nm: 555
Fluoreszenz-Quantenausbeute: 0.63
CF260: 0.57
CF280: 0.18

Verdünnungsmittel: Acetonitril
Kopplungsbedingungen: Standardkopplung, identisch zu normalen Nukleinbasen
Schutzgruppen entfernen: identisch zu geschützten Nukleinbasen
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